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表观♀基因组

ChIP-seq CUT&Tag ATAC-seq RNA-seq WGBS-seq

三维基因组

HiChIP Hi-C ChRD-PET RIC-seq

计算』生物学

组学数︼据标准分析组学数据项■目制分析

ChIP级抗体

H2AK5ac H3K4me1 H3K4me2 H3K4me3 H3K4ac H3K9me1 H3K9me2 H3K9me3 H3K9ac H3K27me1 H3K27me2 H3K27me3 H3K27ac H3K36me1 H3K36me2 H3K36me3 H3K36ac H3K56ac

DNA甲基化抗体〇

5-mCpA antibody 3-Methylcytosine antibody 5-Formylcytosine antibody 5-Carboxylcytosine antibody 5-Hydroxymethylcytosine antibody 5-Methylcytosine antibody AbFlex 5-methylcytosine antibody AbFlex Histone H3K27me3 antibody DNMT1 monomethyl Lys142 antibody Histone H2AQ104me1 antibody Histone H2BK46me2 antibody

转录因子抗体

Boris / CTCFL antibody BRPF1 antibody Caspase-3 antibody AATF / Che-1 antibody AbFlex Ago 1/2/3 antibody AEBP2 antibody AIB1 / SRC-3 antibody AID antibody Aiolos antibody Androgen Receptor antibody

表观基因组试剂盒

CUT&Tag试剂盒 ChIP-seq试剂盒 ATAC-seq试剂盒

DNA文库构建试▃剂盒

DNA Lib Prep Kit for Illumina（通用） DNA Lib Prep Kit for MGI（通用） DNA Lib Prep Kit for Illumina（转座酶）

染色质修饰蛋白抗体

Acf1 antibody ACTL6B antibody ASH2L antibody APOBEC2 antibody ATRX antibody Aurora B antibody BAP1 antibody BAZ2A antibody beta-Catenin antibody BLIMP1 / PRDM1 antibody BMI-1 antibody (mAb) BRD2 antibody CABIN1 antibody

技术服务

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转录因子抗体

Boris / CTCFL antibody BRPF1 antibody Caspase-3 antibody AATF / Che-1 antibody AbFlex Ago 1/2/3 antibody AEBP2 antibody AIB1 / SRC-3 antibody AID antibody Aiolos antibody Androgen Receptor antibody

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WGBS-seq

WGBS-seq

12-272023

全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基（C碱基）的甲基化〓水平，是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异▲性修饰的研究提供重要技术◣支持，能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中，也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。全基因↑组甲基化测序技术通过T4-DNA连接酶，在超声波打断基因组DNA片段的两端连接接头序列，连接产物通过重亚硫酸盐处理将未甲基化修饰的胞嘧啶C转变为尿嘧啶U，进而通过接头序列…

RNA-seq

RNA-seq

12-272023

RNA测序（RNA-seq）是转录组学研究的重要工具，也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性，转录组学◆有以下优势：1）能够动态考察细胞基因组↙的表达，多维度地反映差异变化；2）可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA，研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用；3）与蛋白组学研究相互补充，更全Ψ 面地呈现细胞水平的变化信息。作为转录组学研究的技术基础，RNA测序技术也在不断地更新迭代。RNA-seq（RNA sequencing [1]）即转录组测序技术，就是用…

ChIP-seq

ChIP-seq

05-082022

ChIP (enhanced chromatin immunoprecipitation) 是将染色质免疫共沉淀和高通量测序相结合的技术。通过组蛋白特异性抗体，将带有特定修饰的组蛋白-DNA复合物沉淀下来，从而获取该组蛋白结合的DNA。通过对DNA进行高通量测序，即可获得该组蛋白在染色体上的分布情况。该方法通过直接超声处理被甲醛固定的组织，大大提高了染色质提取的效率，ChIP也适用于其他单子叶和双子叶植物中的修饰Ψ组蛋白和转录因子，ChIP-Seq的总体效率提升至少几十倍以上，可用于鉴定水稻、拟南芥、玉米和甘蓝型油…

CUT&Tag

CUT&Tag

05-082022

CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation, CUT&Tag）是一种研究蛋白质与DNA互作〖的新方法。该方法通过分子生物学手段将高活性的Tn5转座酶与Protein A融合，并装载建库接头引物形成pA-Tn5转座复合物。在抗体的引导下该pA-Tn5转座复合物可靶向切割目的蛋白∑　附近的DNA序列。与传统ChIP-Seq相比，该技术无需交联与超声打断操作，规避了抗原决定簇遮盖和样本损失问题，提高了信噪比，所需细胞量减少（可低至60个）。与CUT&Run相比，该技术在pA-Tn5转座复合物进行切割时…

ATAC-seq

ATAC-seq

05-082022

ATAC-seq技术，全称为：Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing），是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的一种用于研究染色质可及性（通常也理解为染色质的开放性）的方法(Buenrostro, Giresi, Zaba, Chang, & Greenleaf, 2013)。该方法通过超活化Tn5转座酶将序列接头︾插入到染色质开放区域，然后通过DNA测序数据分析推断染色质各区域的可及性、转录因子结合位点以及核小体位置。ATAC-seq可以在全基因组范围…

表观多组学

表观多组学

05-082022

HiChIP

HiChIP

05-082022

HiChIP（in situ *Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation）是一种利用原位Hi-C原理和转座酶介导构建文库来解析染色质构」象的方法。该方法由Howard Chang实验室建立，相关方法论文◤在2016年11月份发表于 Nature Methods.

Hi-C

Hi-C

05-082022

Hi-C（High-throughput chromosome conformation capture），高通量染色质构象捕获技术研究全基因组范围内整▆个染色质在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱，更加全面阐述ㄨ染色质三维结构。同样，Hi-C 可以与 RNA-Seq、ChIP-Seq等多组学数据进行联合分析，进而从基因调¤控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。

ChRD-PET

ChRD-PET

05-082022

ChRD-PET（Chromatin-associated RNA-DNA interactions followed by paired-end-tag sequencing）, 一种植物RNA-DNA互〖作研究技术，其主要原理是利用特异组蛋白修饰抗体，通过染色质免疫共沉淀富集DNA-RNA-蛋白质复合物，用一种生物素标◎记的DNA bridge linker，将复合物上空间接近的RNA和DNA进行连接，通过高通量测序获得DNA和RNA交互的数据。利用这一技术，研究人员构建了水稻H3 ChRD-PET和H3K4me3 ChRD-PET数据，分别表征染色质结合RNA在全基因组上的结合位点，以及染々色质结合RNA与H3…

RIC-seq

RIC-seq

05-082022

RIC-seq技术具有重要的应用价值，可用于系统描绘细胞内全局RNA互作图谱，特别是増强█子与启动子的互作网络，并揭示特定RNA的高级结构与作用靶标。在医学研究方面，利用RIC-seq 技术可系统分析基因突变▼对 RNA 高≡级结构和作用靶标的影响，揭示非编码区突变的致病机理，并为相关疾病的临床诊断和治疗奠定基础。在病毒研究←方面，RIC-seq可用于病毒RNA的结构解析，为病毒感染的机制和开发抗病毒药物，也具有广阔的】应用前景。RIC-seq技术的转化应用，将进一步丰富表观生物在医学表观遗传领域的…

组学数据标准分析

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05-082022

组学数据项目制分析

组学数据项目制分析

05-082022

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