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表观多组学

表观多组学

05-082022

HiChIP

HiChIP

05-082022

HiChIP（in situ *Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation）是一种利用原位Hi-C原理和转座酶介导构建文库来解析染色质构象的方法。该方法由Howard Chang实验︼室建立，相关方法论文在2016年11月份发表于 Nature Methods.

Hi-C

Hi-C

05-082022

Hi-C（High-throughput chromosome conformation capture），高通量染色质构象捕获技术研究全基因组范围内整个染色质在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱，更加全面阐述染色质三维结构。同样，Hi-C 可以与 RNA-Seq、ChIP-Seq等多组学数据进行联合分析，进而从基因调控网络和表观遗传网络来↓阐述生物体性状形成的相关机制。

ChRD-PET

ChRD-PET

05-082022

ChRD-PET（Chromatin-associated RNA-DNA interactions followed by paired-end-tag sequencing）, 一种植物RNA-DNA互作研究技术，其主要原理是利用特异组蛋白修饰抗体，通过染色质免疫共沉淀富集DNA-RNA-蛋白质复合物，用一种生物素标记的DNA bridge linker，将复合物上空间接近的RNA和DNA进行连接，通过高通量测序获得DNA和RNA交互的数据。利用这一技术，研究人员构建了水稻H3 ChRD-PET和H3K4me3 ChRD-PET数据，分别表征染色质结合RNA在全基因组上的结合位点，以及染色质结合RNA与H3…

RIC-seq

RIC-seq

05-082022

RIC-seq技术具有重要的应用价值，可用于系统描绘细胞内全局RNA互作图谱，特别是増强子与启动子的互作网络，并揭示特定RNA的高级结构与作用靶标。在医学研究方面，利用RIC-seq 技术可系统分析基因突变对 RNA 高级结构和作用靶标的影响，揭示非编码区突变的致病机理，并为相关疾病的临床诊断和治疗奠定基础。在病毒研究方面，RIC-seq可用于病毒RNA的结构解析，为病毒感染的机制和◣开发抗病毒药物，也具有广阔的应用前景。RIC-seq技术的转化应☆用，将进一步丰富表观生物在医学表观遗传领域的…

组学数据标准分析

组学数据标准分析

05-082022

组学数据项目制分析

组学数据项目制分析

05-082022

WGBS-seq

WGBS-seq

12-272023

全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基（C碱基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金标【准。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持，能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中，也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。全基因组甲基化测序技术通过T4-DNA连接酶，在超声波打断基因组DNA片段的两端连▆接接头序列，连接产物通过重亚硫酸盐处理将未甲基化修饰的胞嘧啶C转变为尿嘧啶U，进而通过ω接头序列…

ChIP-seq

ChIP-seq

05-082022

ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）是一种强大的技术，用于研究蛋白质如转录因子和组蛋白修饰与DNA的①相互作用。通过这种技术，研究□　人员能够全面理解基因表达的调控机制，揭示细胞内的分子事件和疾病发生的分子基础。本科研服务旨在为广大科研工作者提供高质量◆的ChIP-seq实验和数据分析服务，从而加速科研进展和成果的产出。服务介绍1. 实验设计咨询提供个性∴化实验设计方案，根据研究目的和样本类型选择最合适的ChIP-seq策略。确定目标蛋白质和相应的特异性抗体。2. 样本处理接收多种类型的…

CUT&Tag

CUT&Tag

05-082022

CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation, CUT&Tag）是一种研究蛋白质与DNA互作的新方法。该方法通过分卐子生物学手段将高活性的Tn5转座酶与Protein A融合，并装载建库接头引物形成pA-Tn5转座复合物。在抗体的引导下该pA-Tn5转座复合物可靶向切割目的蛋白附近的DNA序列。与传统ChIP-Seq相比，该技术无需交联与超声打断操作，规避了抗原决定簇遮盖和样本损失问题，提高了信噪比，所需细胞量减少（可低至60个）。与CUT&Run相比，该技术在pA-Tn5转座复合物进行切割时…

ATAC-seq

ATAC-seq

05-082022

ATAC-seq技术，全称为：Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing），是2013年由斯坦福大学▼William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的一种用于研究染色质可及性（通常也理解为染色质的开放性）的方法(Buenrostro, Giresi, Zaba, Chang, & Greenleaf, 2013)。该方法通过超活化Tn5转座酶将序列接头插〖入到染色质开放区域，然后通过DNA测序数据分析推断染色质各区域的可及性、转录因子结合位点以及核小体位置。ATAC-seq可以在全基因组范围…

RNA-seq

RNA-seq

12-272023

RNA测序（RNA-seq）是转录组学研究的重要工具，也是生命科学领域最】常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性，转录组学有以下优势：1）能够动态考察细胞基因组的表达，多维度地反映差异变化；2）可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA，研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用；3）与蛋白组学研究相互补充，更全面地呈现细胞水平的变化信息。作为转录组学研究的技术基础，RNA测序技术也在不断地更新迭代。RNA-seq（RNA sequencing [1]）即转录组测序技术，就是用…

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